剧场版由镰池和马完全原创！在学园都市和魔术阵营方面都将有新的设定、角色和场景的设定原图、故事详情等手机版魔法花园。还有多达到数十张原稿都是由镰池和马为了本次剧场版动画而特别创作的。剧场版监督是锦织博、动画制作是J.C.STAFF!!脚本将启用参与了『加速世界』、『超时空要塞F』的吉野弘幸！
【故事概要】
由学园都市制造的宇宙电梯『恩底弥翁（エンディミオン）』
就在宇宙电梯快要完成的时候的某日，上条和茵蒂克丝遇到了无能力者（LV.0）的少女——鸣护艾丽莎手机版魔法花园。
茵蒂克丝和艾丽莎被名为『旺盛的食欲』这莫名的东西联系起来并意气相投手机版魔法花园。
就在三人享受放学后的快乐时光时，带领着魔术师的史提尔突然攻击了他们手机版魔法花园。
而他们的目标，就是艾丽莎手机版魔法花园。
为什么身为科学侧的她会被魔法侧的人追杀呢手机版魔法花园？
受到魔法侧的攻击，学院都市侧的女头领——夏特奥拉率领着秩序维持部队展开了应对之策手机版魔法花园。
正当被包围的上条、茵蒂克丝和艾丽莎陷入了极端迷惑之时手机版魔法花园，史提尔说道：「那里的女孩，将会让科学侧和魔法侧之间陷入战争」……
当科学与魔法交会之际手机版魔法花园，故事将在『恩底弥翁』这舞台上开始——！
来源：mipaku声优视频（）
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